病原菌即病原微生物（Pathogenic Bacterium），是一种引起疾病的微生物，能入侵宿主引起感染的微生物，例如病毒、细菌、真菌等。

近日，CelLoud生物信息分析云平台成功入驻中国疾病预防控制中心（CDC），为传染病检测和研究提供数据分析服务。

在感染病分子诊断中，基因检测技术（包括PCR技术、sanger技术、高通量测序技术、全基因组测序技术等）可以帮助实现检测病原菌种属类型、监控流行病的爆发、预测耐药性、促进疫苗研发并对个体患者诊断、治疗提供新的建议或方案。也可通过检测病原菌的种属类型，从而针对性的实施个体化治疗或针对性开发治疗该病原菌的微生物制剂。

CelLoud云平台为中国疾病预防控制中心关于SARS、禽流感H5N1，猪链球菌，新布尼亚病毒，禽流感H7N9等等传染病学研究提供在线基因数据生信分析流程。提高数据分析准确性的同时也大大的缩短的分析周期，为疫情预防提供了更充裕的准备时间。

同时，利用通过高通量测序技术（NGS）对细菌16S rDNA的全长序列进行测序，并对数据库中的标准序列进行比对分析，确定细菌的种属类型，从而为患者的个性化治疗提供参考。

病原菌基因检测技术适应人群： 

ü 血培养显示阴性的感染患者，包括败血症、心内膜炎、骨髓炎；

ü 感染了苛求菌或不可培养的微生物的患者；

ü 由于免疫抑制剂导致了对广泛病原体易感的患者；

ü 深层感染需要创伤性活组织检查的患者。